4、触诊：直肠、阴道内诊时，会有子宫荐骨韧带结节、子宫直肠凹陷窝压痛之情形，或腹部触诊时，单侧或双侧卵巢肿块固定不动。
5、CA125化验：检验血中CA-125的数值，CA-125的抗原存在于体内的器官组织中，平常这些抗原，不会释放到血液中，直到组织受损或有异常的增生时，血液中的CA-125便会增加。一般CA-125正常值定位在35u/ml以下，若超过35u/ml便要考虑以下各种疾病：子宫内膜异位、盆腔发炎粘连、子宫肌腺瘤、卵巢癌。它虽然不能作为一种非常有效的疾病筛检方法，一但发现异常，仍不失为一种治疗指针，如果CA-125下降表示效果不错，如果CA-125持续上升可能需要改变治疗方针。
6、腹腔镜检查：可以直接看见病灶部分，病变范围、严重程度，是目前诊断子宫内膜异位症最可靠的方法。
7、超声波检查：有助于了解卵巢是否有巧克力囊肿以及大小和囊肿的位置，同时还会发现盆腔检查时未能扪及的包块。
8、剖腹检查探查，在腹腔镜检查失败，诊断未能明确者，可行剖腹检查。
9、活组织检查，怀疑有宫颈、阴道、腹壁疤痕等部位子宫内膜异位症，于局部病灶处取活组织病理检查。
10、抗子宫内膜抗体（EMAb），是一种以子宫内膜为靶抗原并引起一系列免疫反应的自身抗体，EMAb的产生，一方面是因为异位子宫内膜刺激系统，另一方面是机体的免疫系统失常（自身免疫缺陷）。在子宫内膜异位症患者血清中，EMAb的检出率可达70%-80%。异位的子宫内膜具有抗原性，可诱导机体产生抗子宫内膜抗体，所以患有子宫内膜异位症的女性，产生抗子宫内膜抗体的机会比较大，由于抗子宫内膜抗体的存在，导致受精卵不容易着床，或者着床后也容易流产。抗子宫内膜抗体阳性不一定是子宫内膜异位症，但子宫内膜异位症时有可能会出现抗体阳性。抗子宫内膜抗体的检测不失为一种对子宫内膜异位症患者无损伤的，经济方便的辅助诊断方法，尤其对轻度子宫内膜异位症患者更具价值。